Las principales líneas de investigación de Menarini España están encaminadas a combatir el dolor, la inflamación, las enfermedades cardiovasculares y las enfermedades respiratorias. También investiga nuevos fármacos y promueve estudios en el campo de las infecciones víricas, los trastornos gastrointestinales y la oncología.

El centro de I+D en Badalona es uno de los seis con los que cuenta Menarini Internacional en Europa y el equipo profesional se beneficia de una estrecha colaboración con los restantes centros de I+D de Menarini en el mundo. Está integrado en el Programa Nacional de Biomedicina (Acción PROFARMA). Está acogido al Programa de Fomento de la Investigación del Ministerio de Ciencia y Tecnología (PROFIT) y adherido al Plan de Fomento de la Industria Farmacéutica. En virtud de este plan lleva a cabo intercambios de formación científica y técnica con los ministerios de Sanidad, Industria e Innovación y con otras entidades públicas como el Centro para el Desarrollo Tecnológico e Industrial (CDTI). También colabora con otras empresas para desarrollar fármacos y estudios clínicos que mejoren los tratamientos actuales.

Menarini España también promueve la investigación en otras entidades científicas y académicas. Prueba de ello es la creación de la Cátedra de Investigación y Docencia en Dolor UAB-IMAS-MENARINI.